未满三个月在工厂辞职，扣除工资的30%是合法的

未满三个月辞职扣30%工资，一般违法。依据《劳动法》，除非因劳动者辞职给单位造成损失，否则单位无权随意扣工资。若被扣工资，劳动者权益受损。
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不合法。处理方式：1.与单位沟通，要求合理解释扣工资原因；2.若沟通无果，收集证据，如工资条、合同等；3.向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求返还被扣工资；4.如情况严重，可考虑诉讼维护自身权益。
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未满三个月辞职被扣工资，处理方式有协商、投诉、仲裁等。建议先与单位协商，协商无果可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁来维权。